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maxquant是一款蛋白组学软件包，用于分析大型质谱数据集的定量蛋白质组学，可以进行ProteinID、SILAC、iTRAQ/TMT和label-free等分析。

官方介绍

MaxQuant是一款先进的，免费的用于分析大型质谱数据集的定量蛋白质组学软件包。它是专门针对高分辨率的MS数据。支持多种定量标记技术及非标定量。

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功能介绍

可设置原始数据、组特定参数、全局参数、性能和可视化组态。

能够将质谱产生的RAW文件转换得到相应的肽段和蛋白情况，从而进行下一步分析研究。